肛肠检查方式主要包括肛门部的视诊、肛管直肠的指诊、肛门镜或直肠镜检查等。
一、肛门部的视诊：这其实就是望诊，即通过正确的体位来进行观察。在检查时，会依据怀疑的病种不同而采用不同体位，较为方便的体位通常是侧卧位或膝胸卧位。确定好合适的体位后再开展视诊。
二、肛管直肠的指诊：是用手指进行检查，主要用于判定肛门括约肌的功能，比如是否存在括约肌痉挛、狭窄、松弛等状况，同时也检查直肠内、肛管部位有没有硬结、结节、肿物以及其他可触物等。
三、肛门镜或直肠镜检查：属于窥镜检查，能够观察直肠内部黏膜的情况，比如黏膜是否正常，有无充血、水肿、溃疡、息肉、肛乳头、痔疮等，这些都可以通过肛门部的窥镜检查来进行观测。
对于那些通过上述三种检查方法仍不能完全明确的疾病，在必要时，还可进行B超、CT、磁共振、全结肠镜等检查。
总之，肛肠检查有多种方式，可根据具体情况选择合适的检查方法来明确病情。