面肌痉挛主要是由血管压迫和面神经根部受到刺激等因素导致。据临床研究，约80% - 90%的面肌痉挛是由于面神经出脑干区受到血管压迫引起的，常见的压迫血管有小脑上动脉、小脑前下动脉等。
血管压迫因素
动脉压迫： 小脑上动脉是最常见的压迫血管，它从脑干发出后，可能会与面神经根部紧密接触，长期的血管搏动刺激面神经，使得面神经的神经纤维之间发生“短路”，从而导致面肌痉挛。这种压迫在中老年人中相对更常见，随着年龄增长，血管发生硬化等改变，更容易出现对神经的压迫情况。静脉压迫： 除了动脉，静脉也可能对面神经造成压迫。比如岩静脉等静脉血管，当它们异常走行压迫到面神经时，也会引发面神经的异常兴奋，进而导致面肌痉挛的发生。不过相对动脉压迫来说，静脉压迫导致面肌痉挛的比例相对低一些。
面神经根部受刺激
先天发育异常： 部分人可能存在面神经根部的先天发育异常情况，比如面神经出脑干区的解剖结构异常，使得面神经更容易受到周围组织的刺激。这种先天因素导致的面肌痉挛可能在较年轻时就会发病。炎症因素： 面神经根部如果曾经发生过炎症，比如病毒感染引起的面神经炎等，在炎症恢复后，可能会导致面神经的神经鞘膜受到损伤，使得面神经的传导功能发生紊乱，也容易引发面肌痉挛。像带状疱疹病毒感染累及面神经时，就有一定概率在恢复后出现面肌痉挛的后遗症。
其他可能因素
遗传因素： 虽然面肌痉挛的遗传因素相对不是主要的，但有研究发现，少数家族中可能存在面肌痉挛的遗传倾向。如果家族中有亲属患有面肌痉挛，那么其他家庭成员患病的风险可能会比普通人群略高一些，但这种遗传因素导致的面肌痉挛比例非常低。心理因素： 长期的精神紧张、焦虑、压力过大等心理因素也可能会诱发或加重面肌痉挛。当人处于高度紧张状态时，身体的交感神经兴奋，可能会影响面神经的正常功能，使得面肌痉挛的症状更加明显。不过心理因素一般是作为诱发或加重的因素，而不是原发性的致病因素。