甲状腺肿大的原因有多种。一般来说，碘缺乏是常见原因之一，当人体长期处于碘摄入不足状态时，就容易引发甲状腺肿大，比如在一些远离海洋且碘供应不足的地区，人群中甲状腺肿大的发生率相对较高。
碘代谢相关因素导致
碘缺乏： 人体摄入碘不足时，甲状腺会代偿性增生肿大。像一些山区、高原地区，由于土壤、水源中碘含量低，居民长期从饮食中获取碘少，就易出现甲状腺肿大。碘过量： 虽然碘缺乏易致甲状腺肿大，但碘摄入过多也可能引发。比如长期大量食用含碘丰富的食物，像海带等，或者长期服用含碘药物，都可能打破甲状腺碘代谢平衡，引起甲状腺肿大。
自身免疫因素影响
自身免疫性甲状腺炎： 例如慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病），是自身免疫系统错误攻击甲状腺组织，导致甲状腺肿大。这种疾病在女性中相对更常见，发病机制与遗传、环境等多种因素有关。Graves病： 也是自身免疫性疾病，患者体内产生针对甲状腺的抗体，刺激甲状腺过度增生和激素分泌，出现甲状腺肿大，同时常伴有甲亢相关症状，如心慌、多汗、消瘦等。
药物及其他因素作用
某些药物： 一些药物可能影响甲状腺功能导致肿大。比如胺碘酮，它含有较高碘，长期服用可能干扰甲状腺正常代谢，引发甲状腺肿大。先天性甲状腺激素合成障碍： 由于基因突变等原因，导致甲状腺激素合成过程中相关酶缺陷，使甲状腺激素合成不足，反馈刺激垂体分泌促甲状腺激素增多，进而引起甲状腺肿大，这种情况多在儿童时期就可表现出来。