生化妊娠和宫外孕可以从以下方面分辨：首先，血HCG数值变化不同。生化妊娠时，血HCG能测到怀孕，但一般小于200IU/L，之后会逐渐下降至正常；而宫外孕时，血HCG值通常低于正常宫内妊娠，而且翻倍不好，比如正常宫内孕48小时血HCG能翻倍，但宫外孕往往翻倍缓慢。
临床表现差异
阴道出血情况： 生化妊娠常表现为月经推迟几天后出现阴道流血，类似月经来潮，出血量可能和平时月经量差不多；宫外孕患者也会有阴道出血，一般是不规则阴道流血，量少，呈点滴状，色暗红或深褐。腹痛表现： 生化妊娠一般腹痛症状不明显；宫外孕患者会有下腹部隐痛或酸胀感，如果宫外孕发生破裂，会出现一侧下腹部撕裂样疼痛，同时伴有恶心、呕吐等症状，严重时会出现晕厥、休克。
B超检查结果不同
B超下宫内情况： 生化妊娠时，B超检查宫腔内看不到妊娠囊；宫外孕时，B超检查宫腔内无妊娠囊，在输卵管等宫外孕常见部位可发现异常包块。比如宫外孕发生在输卵管，B超下能看到输卵管部位有不均质回声包块。妊娠囊位置： 生化妊娠不存在妊娠囊着床的情况；宫外孕是受精卵着床在子宫体腔以外的部位，这是两者本质的不同点。