生化妊娠和宫外孕可以从定义、血hCG变化、超声表现来辨别。生化妊娠是指精卵结合后，没有着床成功的妊娠，血hCG一般在5~200IU/L之间，超声检查看不到孕囊；而宫外孕是受精卵在子宫体腔以外着床，血hCG增长缓慢，通常低于正常宫内妊娠的增长速度，超声检查在宫腔内找不到孕囊，在宫外可发现异常包块。
定义差异
生化妊娠： 它是一种早期流产，是精子和卵子结合形成受精卵后，没有成功回到子宫着床，随着月经一起流产的现象。一般发生在怀孕5周内。宫外孕： 受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，常见的着床部位是输卵管，也有少部分会着床在卵巢、宫颈等部位。
血hCG表现不同
生化妊娠血hCG： 血hCG能测出来，但数值很低，一般在5~200IU/L左右，而且不会像正常怀孕那样隔天翻倍增长，而是会逐渐下降。宫外孕血hCG： 血hCG水平较正常宫内妊娠低，比如正常宫内妊娠40天左右血hCG可能在2000IU/L以上，而宫外孕时血hCG可能几十到几百IU/L，而且翻倍时间长，通常大于7天。
超声表现区别
生化妊娠超声： 做超声检查时，子宫内看不到孕囊，因为受精卵没有着床成功。宫外孕超声： 在超声下可以看到宫外有异常的包块，比如输卵管妊娠时，可能在输卵管部位看到低回声区，有时还能看到胚芽或心管搏动。如果宫外孕包块破裂，还会在盆腔看到游离的无回声区。