胃食管反流常见的症状有很多，其中最典型的是烧心，大约有50%~70%的患者会出现，表现为胸骨后烧灼感，通常在进食后1小时左右出现。另外，反酸也是常见症状，约有30%~60%的患者会有，是指胃内容物在无恶心和不用力的情况下涌入咽部或口腔的感觉。
典型消化道症状
烧心： 是胃食管反流很突出的症状，多在餐后1小时左右出现，卧位、弯腰或腹压增高时易加重。比如进食较多油腻食物后，更容易出现烧心感。反酸： 胃内容物经食管反流达口咽部，口腔感觉到酸性物质。有时在空腹时也可能发生，比如半夜醒来感觉口中有酸水。
非典型消化道症状
胸痛： 约有40%的患者会出现胸痛，疼痛部位在胸骨后，可放射至心前区、后背、肩部等，类似心绞痛的症状，但一般没有冠心病的心电图改变。疼痛程度不一，有的较轻，有的较剧烈。吞咽困难： 部分患者会有吞咽困难的表现，初期可能是间歇性发作，当病情加重时可呈持续性吞咽困难。这是因为食管痉挛或食管狭窄导致的。
食管外症状
咳嗽： 约有10%~40%的胃食管反流患者会出现咳嗽症状，多为慢性咳嗽，一般是干咳，有时也会有少量白痰。这是由于反流物刺激咽喉部或气管引起的。哮喘： 约有5%~10%的哮喘患者与胃食管反流有关，胃食管反流可能会诱发或加重哮喘发作，而且这类哮喘用常规平喘药物治疗效果不佳。咽喉不适： 患者可能会感觉咽喉部有异物感、痒感、刺痛感等，还可能出现声音嘶哑，这是因为反流物刺激咽喉部黏膜导致的。