慢性胃肠炎常见的症状有消化系统方面的表现，比如约半数以上的慢性胃肠炎患者会出现上腹不适，表现为隐痛、胀痛等，进食后可能会有加重或无明显规律。还可能有食欲减退的情况，大约30% - 40%的患者会感觉吃饭没胃口，食量较以前减少。
消化系统症状表现
腹痛表现： 疼痛程度不一，有的是隐隐作痛，有的是胀痛，位置多在上腹部，疼痛没有固定的规律，可能在进食后出现，也可能在空腹时发生。食欲情况： 患者常常感觉食欲不佳，看到食物没有强烈的进食欲望，食量明显减少，长期如此可能会导致体重下降。
肠道相关症状
腹泻情况： 部分慢性胃肠炎患者会出现腹泻，一般是稀便，每天排便次数可能在3 - 5次左右，有的患者是间断性腹泻，有的则是持续性的。便秘表现： 也有一些患者会出现便秘，大便干结，排便困难，间隔时间较长才会有一次排便。
全身伴随症状
乏力表现： 由于胃肠功能紊乱，营养吸收受到一定影响，患者容易感到乏力，精神状态不佳，稍微活动就会觉得疲惫。消瘦情况： 如果病情持续时间较长，营养摄入不足，会出现消瘦的情况，体重会逐渐下降，一般在数月内体重可能会减轻3 - 5公斤甚至更多。