滴虫性尿道炎主要由阴道毛滴虫感染引起，治疗上常用硝基咪唑类药物。一般确诊后使用相关药物治疗，通常能取得较好效果。
药物治疗选择
甲硝唑： 是治疗滴虫性尿道炎的常用药物，它能抑制滴虫的氧化还原反应，使虫体氮链断裂，从而发挥杀灭滴虫的作用。替硝唑： 也属于硝基咪唑类药物，对滴虫的作用与甲硝唑类似，可用于治疗滴虫性尿道炎。
生活方式调整
个人卫生清洁： 要保持外阴清洁干燥，每天用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤最好用开水烫洗后在阳光下暴晒，以达到杀菌的效果。避免性生活： 在治疗期间应避免性生活，因为滴虫可通过性接触传播，性生活可能会导致交叉感染，使病情难以治愈或反复发作。一般建议治疗结束后复查滴虫阴性，且连续复查2 - 3次都为阴性后，再恢复正常性生活。
性伴侣治疗
性伴侣同时治疗： 滴虫性尿道炎主要通过性接触传播，所以性伴侣也需要同时接受治疗，否则即使一方治疗好了，另一方再通过性接触又会将滴虫传染回来，导致疾病反复。性伴侣的治疗方案与患者相同，也需使用硝基咪唑类药物进行治疗。告知性伴侣病情： 在治疗前要告知性伴侣自己患有滴虫性尿道炎，让性伴侣重视并积极配合治疗，避免隐瞒病情导致双方反复感染。
复查随访
定期复查： 在治疗结束后，一般建议患者在下次月经干净后复查白带常规，查看是否还有滴虫存在。如果第一次复查未发现滴虫，还需要在下次月经干净后再次复查，连续复查3次均为阴性才算彻底治愈。关注病情变化： 在治疗期间和治疗后都要关注自身症状，如果症状没有缓解甚至加重，如尿道瘙痒、疼痛等症状持续存在或加重，应及时就医复诊，调整治疗方案。