近亲结婚生出的孩子患遗传病的风险会明显增加。据统计，近亲结婚所生子女的隐性遗传病发病率比非近亲结婚高150倍左右。
遗传病风险升高
常染色体隐性遗传病：近亲双方可能携带相同的隐性致病基因，当他们结合后，子女获得两个致病基因的概率大大增加。比如白化病，正常人群中约每70人就有1人携带白化病的隐性致病基因，而近亲结婚的夫妇携带相同致病基因的几率比非近亲夫妇高很多，他们的孩子患白化病的概率就会显著升高。X连锁隐性遗传病：像血友病等疾病，男性患者的X染色体携带致病基因，女性可能是携带者。近亲结婚时，这类隐性致病基因传递给后代导致发病的风险也会大幅提升。
先天畸形几率增加
骨骼系统畸形：近亲结婚可能使孩子出现多指、并指等骨骼方面的先天畸形。这是因为近亲双方的基因缺陷容易影响胚胎发育过程中骨骼的正常形成和分化。心血管系统畸形：例如先天性心脏病，近亲结婚所生婴儿患先天性心脏病的几率比非近亲结婚高出2 - 3倍。这是由于基因的缺陷可能干扰心脏发育的正常进程，导致心脏结构出现异常。
智力发育受影响
智力低下风险：近亲结婚的孩子更容易出现智力发育迟缓的情况。研究发现，近亲结婚家庭中智力低下儿童的出生率比非近亲结婚家庭高很多。这是因为近亲双方的基因组合可能不利于大脑的正常发育，影响了神经系统的结构和功能，从而导致孩子在智力方面受到不良影响。
生长发育受阻
身高体重偏离：近亲结婚的孩子在生长发育过程中，身高和体重往往可能偏离正常的生长曲线。他们可能比同龄非近亲结婚家庭的孩子身高更矮、体重更轻。这是因为基因的缺陷可能影响了身体的代谢和生长调节机制，使得孩子的生长发育受到阻碍。