治口腔溃疡没有绝对“最好”的药，一般局部用药能较快缓解症状，比如使用含漱剂、含片等。像氯己定含漱液，通常用药后1 - 2天能看到一定效果，价格一般在几元到十几元不等。
局部用药来缓解
含漱剂： 常用的有0.1%葡萄糖酸氯己定含漱液，它能杀灭口腔内的细菌，抑制菌斑形成，从而帮助口腔溃疡愈合，使用时每次含漱10 - 20毫升，含漱1分钟左右吐出。含片： 西地碘含片也是常用的，它可以在口腔内缓慢释放碘，有杀菌抗感染的作用，含服时一次1片，一日3 - 5次。
促进愈合类药物
黏膜保护剂： 复方甘菊利多卡因凝胶属于这类药物，它可以在溃疡表面形成保护膜，减轻疼痛，还能促进溃疡愈合，使用时取适量涂于溃疡部位，一日3 - 4次。生长因子类药物： 重组人表皮生长因子凝胶也能促进口腔溃疡创面的愈合，直接涂抹在溃疡处即可，一般每天使用2 - 3次。
免疫调节类药物
局部用激素： 如醋酸地塞米松粘贴片，它可以起到抗炎、抗过敏的作用，将贴片贴于溃疡处，一次1片，一日总量不超过3片，连续使用不超过7天。但孕妇、哺乳期妇女以及对激素过敏者要慎用。口服免疫调节药： 对于反复复发的口腔溃疡，可能会用到沙利度胺等药物，但这类药物有一定的副作用，比如可能会引起嗜睡等，需要在医生严格评估后使用，一般不用于儿童等特殊人群。
注意事项及特殊人群
儿童需谨慎： 儿童使用治疗口腔溃疡的药物要格外小心，比如含漱剂，儿童可能不会正确使用，容易误吞，所以儿童用药最好在成人监护下进行，并且优先选择相对安全的局部用药。孕妇和哺乳期女性： 这类人群使用药物更要谨慎，很多药物可能会通过胎盘或乳汁影响胎儿或婴儿，所以在使用治疗口腔溃疡的药物前，一定要咨询医生，选择对胎儿和婴儿影响较小的药物。同时，无论是哪种药物，使用时都要按照说明书的要求或医生的嘱咐来用，不要自行增减剂量或延长使用时间。