消化性溃疡的临床表现多样，其中最典型的是慢性、周期性、节律性上腹痛。约90%的十二指肠溃疡患者和80%的胃溃疡患者会出现上腹痛，疼痛多在进食后一段时间发作，比如十二指肠溃疡常为空腹痛，多在餐后2~4小时出现，进食后缓解；胃溃疡多在餐后1小时内发生疼痛，1~2小时后缓解。
疼痛特点方面
部位： 疼痛部位多在上腹部，十二指肠溃疡疼痛常发生在剑突下偏右处，胃溃疡疼痛多在剑突下偏左处。疼痛范围一般较局限，直径约数厘米。性质： 疼痛性质多样，可为钝痛、胀痛、灼痛、剧痛、饥饿样不适等。一般程度较轻至中度，能忍受，但也有部分患者疼痛较剧烈。
其他消化系统症状方面
反酸、嗳气： 溃疡患者常有胃酸分泌过多的情况，导致反酸，即胃内酸性内容物反流至口腔。同时，还可能出现嗳气，表现为气体从口腔排出，有时可伴有酸腐味。大约有半数左右的消化性溃疡患者会出现反酸、嗳气症状。恶心、呕吐： 溃疡活动期时，患者可能会出现恶心、呕吐症状。呕吐多为胃内容物，呕吐后腹痛症状有时可暂时缓解。一般十二指肠溃疡引起呕吐的情况相对较少，而胃溃疡较易出现呕吐症状，尤其是幽门管溃疡患者，呕吐可能较为频繁。
全身症状方面
失眠、多汗： 部分患者会伴有失眠、多汗等自主神经功能紊乱的表现。这是因为溃疡病是一种身心疾病，与精神因素有一定关系，当溃疡活动时，精神紧张等因素可导致自主神经功能失调，出现失眠、多汗现象。一般有1/3左右的患者会出现这类全身症状。体重变化： 胃溃疡患者有时会因进食后疼痛而不敢进食，导致体重减轻；而十二指肠溃疡患者常因疼痛在进食后缓解，食欲较好，可能会有体重增加的情况，但如果溃疡出现并发症，如出血等，也会导致体重下降。