衣原体感染的症状因感染部位不同而有所差异。男性感染衣原体时，可能出现尿道炎症状，如尿道刺痒、烧灼感，还可能有少量稀薄分泌物，晨起时可能发现尿道口有痂膜封口；女性感染衣原体，可能引发宫颈炎，出现阴道分泌物增多、性交后出血等症状，若上行感染至输卵管等部位，还可能导致盆腔炎，表现为下腹部疼痛、发热等，部分女性可能出现月经紊乱等情况。
男性衣原体感染常见症状
尿道不适表现： 男性感染衣原体后，早期可能感觉尿道内轻微刺痒，随着病情发展，会出现明显的烧灼感，排尿时不适感可能加重。一般这种不适症状会持续存在，若不及时处理，不会自行缓解。分泌物情况： 部分男性患者会有少量稀薄的分泌物，颜色多为透明或微白。在晨起时，可能会发现尿道口有痂膜封住，导致尿道口轻度红肿。
女性衣原体感染常见症状
宫颈炎表现： 女性感染衣原体引发宫颈炎时，阴道分泌物会增多，与正常的白带状态不同，可能变得浓稠、颜色异常。同时，部分女性会出现性交后出血的情况，这是因为炎症刺激导致宫颈组织比较脆弱，性交时容易出血。盆腔炎相关症状： 若衣原体感染上行导致盆腔炎，女性会出现下腹部疼痛，疼痛程度因人而异，有的可能是隐痛，有的则较为剧烈。还可能伴有发热症状，体温一般在38℃左右，部分患者发热可持续数天。另外，盆腔炎还可能影响月经，导致月经紊乱，出现月经量增多、月经周期改变等情况。
新生儿衣原体感染症状
眼结膜感染： 新生儿通过产道感染衣原体后，多在出生后5~14天出现眼结膜感染症状，表现为眼结膜充血、水肿，有较多脓性分泌物，若不及时治疗，可能影响视力发育。呼吸道感染： 部分新生儿还可能出现呼吸道感染症状，如咳嗽，多为干咳，症状可能会逐渐加重，严重时可能影响呼吸，导致呼吸急促等表现。