扁平疣可以外用维A酸类药膏，比如0.1%维A酸乳膏，一般连续使用数周可能见到效果，但具体起效时间因人而异。
维A酸类药膏：
0.1%维A酸乳膏： 通过调节表皮细胞的增殖和分化，使疣体逐渐消退。使用时要注意避免用于皮肤破损处，而且孕妇禁用，用药部位要避免日光照射。他扎罗汀凝胶： 属于第三代维A酸类药物，作用机制与维A酸类似，能改善扁平疣的皮损状况。使用时可能会有局部刺激反应，如红斑、脱屑等，敏感肌肤者要谨慎使用。
抗病毒类药膏：
重组人干扰素α-2b凝胶： 具有抗病毒和免疫调节作用，可通过抑制病毒复制，增强机体免疫功能来发挥治疗扁平疣的效果。一般需要连续使用几周，部分人使用后局部可能有轻度瘙痒、灼痛等不适。咪喹莫特乳膏： 能调节局部免疫反应，刺激机体产生抗病毒蛋白等发挥作用。使用后可能出现局部炎症反应，如红斑、糜烂等，用药时要避免接触正常皮肤。
水杨酸类药膏：
水杨酸软膏： 水杨酸可以促进表皮剥脱，帮助去除疣体。使用时要注意浓度和使用范围，避免大面积长期使用，可能会引起局部刺激，如烧灼感、红肿等。复方水杨酸苯甲酸搽剂： 其中的水杨酸等成分也有一定的角质剥脱作用，对扁平疣有一定的治疗作用，但使用时要注意避免接触眼睛和黏膜部位。需要注意的是，外用药物治疗扁平疣的效果个体差异较大，有些可能需要联合其他治疗方法，如冷冻、激光等。而且在使用药膏过程中，如果出现严重的不良反应，如剧烈疼痛、红肿加重等，要及时停药并就医。同时，扁平疣具有传染性，要注意避免搔抓，防止自身接种传播。