附睾炎主要由细菌、病毒感染以及尿液反流等因素引起。比如，大肠杆菌等细菌感染是常见原因之一，大约50%的附睾炎与细菌逆行感染有关。
细菌感染引发附睾炎
致病菌入侵： 大肠杆菌是引发附睾炎常见的细菌之一，它可通过尿道逆行进入输精管，进而侵袭附睾引发炎症。例如，当人体免疫力下降时，大肠杆菌更容易趁虚而入。尿道操作影响： 像导尿、尿道器械检查等操作，可能会把细菌带入尿道，然后蔓延到附睾导致感染。这类操作后发生附睾炎的风险相对较高。
病毒感染导致附睾炎
腮腺炎病毒相关： 儿童及青少年附睾炎有时由腮腺炎病毒引起。约20%的腮腺炎患者会并发附睾炎，一般在腮腺炎发病后4 - 6周出现附睾炎症状。病毒直接侵袭： 腮腺炎病毒可通过血液传播到附睾，直接侵害附睾组织，引发炎症反应，出现附睾肿胀、疼痛等表现。
尿液反流引发附睾炎
解剖结构因素： 男性的尿道较长，而且尿道有一定的生理弯曲，当尿液反流时，尿液中的化学物质等可能会刺激附睾。比如，患有前列腺增生等疾病时，尿液反流进入输精管的几率增加，从而诱发附睾炎。长期刺激作用： 长期的尿液反流会持续对附睾产生刺激，使附睾处于炎症的环境中，久而久之就容易引发附睾炎。