早晨起来有痰，可能由慢性咽炎、慢性扁桃体炎、支气管炎等因素导致，具体情况如下：
一、慢性咽炎：当患者长期处于受凉、疲劳、营养不良等状态，会使机体免疫力降低，此时就很容易遭受细菌或病毒感染，从而引发咽部黏膜炎症，形成慢性咽炎。由于患者在夜间睡眠时多会用口呼吸，这会刺激咽部黏膜，使其分泌物增多，进而导致早上起来喉咙有痰的现象，同时还会伴有鼻塞、咽痛、咳嗽等症状。
1.受凉：身体长时间受到寒冷刺激。
2.疲劳：过度劳累导致身体疲惫。
3.营养不良：身体缺乏必要的营养物质。
二、慢性扁桃体炎：在长期受到辛辣食物刺激、维生素缺乏、感冒等因素影响，致使机体免疫力下降，而当受到细菌或病毒感染时，就容易诱发扁桃体炎症。夜间主要以副交感神经兴奋为主，会引起咽喉部黏膜分泌物增多，喉咙分泌物在夜间堆积，通常表现为早上起来喉咙有痰。
1.辛辣食物刺激：经常食用辛辣刺激性食物。
2.维生素缺乏：体内维生素含量不足。
3.感冒：发生感冒等疾病。
三、支气管炎：主要源于细菌和病毒的反复感染，或是因空气污染、吸烟等原因造成气管、支气管黏膜及其周围组织的非特异性炎症。支气管炎会致使出现白色粘液状痰液，且痰液粘稠不易咳出。夜间可因体位和副交感神经兴奋而使排痰量增加，常出现早上起来有咳嗽、咳痰的症状。
1.细菌和病毒反复感染：细菌和病毒多次侵袭。
2.空气污染：所处环境空气污染严重。
3.吸烟：有吸烟的习惯或长期处于二手烟环境。
总结概况提示：早晨起来有痰的原因多样，包括慢性咽炎、慢性扁桃体炎和支气管炎等，各自有着不同的诱发因素和症状表现。