三个月宝宝掉头发，原因包括以下这些：
一、正常的生理性情况。三个月宝宝新陈代谢较为旺盛，会长出新发替代旧发，所以通常会有掉发情况出现，不过一般掉发量不多，这属于生理性情况，无需特殊治疗。
二、病理性情况。如果三个月宝宝缺乏微量元素，特别是缺钙，容易导致宝宝频繁摇头，进而出现掉发以及枕秃现象。若是这种原因引起的，要及时给宝宝补充钙质，如碳酸钙、乳酸钙等，同时也可以补充维生素D，这样能缓解因缺钙导致的掉发情况。此外，在日常生活中，适当让宝宝晒太阳，可缓解缺钙症状，促进钙的吸收。如果宝宝是吃母乳，家长也可以多吃一些含钙和维生素D的食物，如鸡蛋、牛奶、蘑菇、橙汁等。
总结：三个月宝宝掉发可能是生理性或病理性原因导致，要注意区分，病理性的缺钙引起的掉发可通过补充相关元素等来改善。