肠结核是由结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，其症状表现多样。一般来说，肠结核患者可能会有长达数周或数月的病程。
消化道症状表现
腹痛：多位于右下腹，因肠结核好发于回盲部。疼痛性质多样，可为隐痛或钝痛，有时在进餐时诱发，还常伴有便意，排便后可稍有缓解。腹泻与便秘交替：溃疡型肠结核常表现为腹泻，粪便多呈糊样，一般无脓血，每日数次不等，有时患者会出现腹泻与便秘交替的情况；而增生型肠结核多以便秘为主要表现。
全身症状表现
发热：多数患者有午后低热或不规则热，伴有盗汗。发热可持续数周甚至数月，体温一般在37.5℃~38.5℃之间。病情严重时，还可能出现高热，体温可达39℃以上。消瘦、乏力、贫血：由于结核分枝杆菌感染导致机体消耗增加，患者会出现消瘦、乏力的表现，长期慢性失血等还可导致贫血，面色苍白。
腹部体征表现
腹部压痛：右下腹常有固定性压痛，压痛点比较局限。腹部肿块：增生型肠结核可触及腹部肿块，质地中等，比较固定，伴有轻度或中度压痛。肿块多位于右下腹，是由于肠壁增厚及周围组织粘连形成。
其他表现
肠梗阻：多见于增生型肠结核，为部分性肠梗阻，表现为腹胀、腹痛、呕吐、停止排气排便等。如果是溃疡型肠结核，可能会并发肠穿孔等情况，但相对较少见。