口腔溃疡的造成原因有多种。一般来说，大约20% - 30%的人会受到复发性口腔溃疡的困扰。
局部创伤因素
口腔内机械性损伤： 比如刷牙时用力过猛，不小心划伤口腔黏膜；或者吃了比较硬的食物，像坚果、脆骨等，刮伤了口腔内壁，就容易引发口腔溃疡。另外，牙齿的残根、残冠也会不断摩擦口腔黏膜，长期刺激就会导致局部出现溃疡。佩戴不合适的假牙： 如果假牙的材质不合适，或者佩戴的尺寸、形状不合适，长时间与口腔黏膜摩擦，也会引起口腔溃疡。例如假牙边缘过于锐利，就会反复刺激口腔组织，形成溃疡创面。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6、B12时，容易出现口腔溃疡。比如长期偏食、挑食的人，很容易因为维生素摄入不足而引发口腔溃疡。一般正常成年人每天需要摄入一定量的维生素B族，像维生素B2每天大约需要1.2 - 1.5毫克。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素的缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种代谢过程，缺乏锌时会影响细胞的正常分裂和修复，从而导致口腔溃疡发生。例如一些素食者，如果饮食中锌的摄入不足，就更容易出现口腔溃疡问题。
免疫系统因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，引发口腔溃疡。比如患有白塞病的患者，就会经常出现口腔溃疡，同时还可能伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状。这类患者的免疫系统处于异常活跃状态，导致口腔黏膜反复受损。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如长期处于疲劳状态、患有慢性疾病（如糖尿病、贫血等）、过度劳累、睡眠不足等情况下，身体抵御外界病菌的能力下降，就容易受到病菌侵袭，从而引发口腔溃疡。例如长期熬夜的人，免疫力会降低，口腔溃疡的发病几率就会增加。