直肠炎的治疗药物需根据病情类型选择，一般来说，常用的药物有氨基水杨酸制剂、糖皮质激素等。例如，对于轻中度的溃疡性直肠炎，氨基水杨酸制剂如美沙拉嗪可能是常用药物之一。
氨基水杨酸制剂类药物
柳氮磺吡啶： 是常用的氨基水杨酸制剂，它在肠道内分解为5 - 氨基水杨酸和磺胺吡啶，5 - 氨基水杨酸可以抑制炎症反应。不过，部分患者可能会出现恶心、呕吐等胃肠道不适症状。美沙拉嗪： 也属于氨基水杨酸制剂，它局部作用于肠道黏膜，减轻炎症。它的不良反应相对较少，可能偶尔会有头痛、头晕等情况，但一般比较轻微。
糖皮质激素药物
泼尼松： 属于糖皮质激素，对于直肠炎病情较重的患者，可起到快速抗炎的作用。但长期使用泼尼松可能会引起骨质疏松、血糖升高、免疫力下降等不良反应，所以需要在医生的严密监测下使用。氢化可的松： 也可用于直肠炎的治疗，一般通过局部灌肠的方式给药。使用氢化可的松时要注意可能出现的局部刺激等情况，长期使用全身吸收后也会有类似泼尼松的一些全身性不良反应。
微生态制剂类药物
双歧杆菌三联活菌胶囊： 可以调节肠道菌群，改善肠道微生态环境，对于直肠炎伴有肠道菌群失调的患者有一定帮助。它一般没有明显的毒副作用，但在保存时需要注意冷藏。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 同样是调节肠道菌群的药物，能促进有益菌生长，抑制有害菌，对直肠炎引起的肠道功能紊乱有一定的改善作用。服用时要用温水送服，避免温度过高影响药效。