黄体功能不全是指卵巢排卵后形成的黄体内分泌功能不足，以致孕激素分泌不足，使子宫内膜分泌转化不足，出现排卵性功血，且不利于受精卵着床，可导致不孕或习惯性流产。其成因主要有以下几方面：
内分泌调节异常
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴功能紊乱：下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）、垂体分泌的促黄体生成素（LH）和促卵泡生成素（FSH）等激素的分泌失调，会影响黄体的发育。比如，当LH分泌量不足时，就无法有效促使黄体正常发育并分泌足够的孕激素。一般来说，正常的激素分泌有其相对稳定的节律和水平，若这种平衡被打破，就可能引发黄体功能不全。自身抗体影响：体内存在抗卵巢抗体、抗子宫内膜抗体等自身抗体时，会对卵巢的黄体细胞产生攻击作用，干扰黄体的正常功能，导致孕激素分泌减少，从而引发黄体功能不全。目前研究发现，自身免疫性疾病患者中黄体功能不全的发生率相对较高。
子宫内膜因素
子宫内膜受体异常：子宫内膜细胞上的孕激素受体数量或功能出现异常，会使子宫内膜对孕激素的敏感性降低。即使黄体分泌了一定量的孕激素，子宫内膜也不能做出正常的分泌期改变，影响受精卵的着床和发育。例如，某些子宫内膜病变可能会导致孕激素受体表达减少或结构异常。子宫内膜容受性问题：子宫内膜容受性是指子宫内膜允许胚胎着床的一种状态，若子宫内膜容受性不佳，即便黄体功能正常，也可能不利于受精卵着床，而黄体功能不全时这种情况会更加明显。子宫内膜容受性受到多种因素调控，黄体功能不全时相关调控机制出现紊乱会影响其正常功能。
其他因素
高泌乳素血症：血液中泌乳素水平过高会抑制LH的分泌，进而影响黄体的生成和功能。临床上，一些患有高泌乳素血症的女性可能会出现黄体功能不全的情况。例如，垂体泌乳素瘤患者常伴有泌乳素升高，从而影响生殖内分泌功能。不良生活方式：长期熬夜、过度节食等不良生活方式也可能影响黄体功能。长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常节律；过度节食会导致身体营养摄入不足，影响激素合成所需的原料，进而干扰黄体的正常功能。研究表明，长期处于不良生活方式下的人群，黄体功能不全的发生风险可能会增加。