黄体功能不全是指卵巢排卵后形成的黄体内分泌功能不足，以致孕激素分泌不足，使子宫内膜分泌转化不足，出现排卵性功血，且不利于受精卵着床，可导致不孕或习惯性流产。其引起的原因主要有以下几方面：
内分泌调节异常
垂体分泌激素异常： 垂体分泌的促卵泡生成素、促黄体生成素等如果比例失调，就可能影响黄体的正常发育。比如促黄体生成素分泌不足时，会影响黄体的形成和功能。一般来说，正常的垂体激素分泌是维持黄体功能正常的重要基础，当这种平衡被打破，就容易出现黄体功能不全。下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴功能紊乱： 该轴的调节出现问题，会使得黄体期异常。比如精神紧张、压力过大等因素可能干扰下丘脑的功能，进而影响垂体和卵巢的激素分泌，最终影响黄体功能。长期处于不良情绪状态下的女性，发生黄体功能不全的风险相对较高。
子宫内膜因素
子宫内膜受体异常： 子宫内膜中的孕激素受体数量和质量异常时，即使有正常水平的孕激素，子宫内膜也不能做出正常的反应。例如孕激素受体缺乏或含量不足，就会导致子宫内膜对孕激素的敏感性降低，影响受精卵的着床和发育，从而与黄体功能不全相关。子宫内膜容受性问题： 正常情况下，子宫内膜需要具备良好的容受性才能接纳受精卵。而黄体功能不全时，孕激素分泌不足会影响子宫内膜容受性的建立，使得子宫内膜的状态不利于胚胎着床，进而可能导致不孕或流产等情况发生。
其他因素
医源性因素： 某些药物的使用可能会影响黄体功能。比如长期使用避孕药等激素类药物，可能会干扰体内正常的激素调节，从而影响黄体的功能。还有一些女性在接受促排卵治疗等医疗干预后，也可能出现黄体功能不全的情况，这与药物对卵巢功能的影响有关。全身性疾病影响： 一些全身性疾病也可能间接导致黄体功能不全。比如甲状腺功能减退症，甲状腺激素水平异常会影响内分泌系统的整体功能，进而波及黄体的正常功能。研究发现，甲状腺功能减退的女性中，黄体功能不全的发生率相对较高。此外，高泌乳素血症等疾病也可能对黄体功能产生不良影响。