宫外孕形成的原因有多种，其中输卵管因素较为常见，大约90%的宫外孕是输卵管妊娠。输卵管出现问题会影响受精卵正常运行，比如输卵管炎症，它分为输卵管黏膜炎和输卵管周围炎，输卵管黏膜炎严重时可引起管腔完全堵塞导致不孕，轻者管腔变窄，或纤毛功能受损，影响受精卵在输卵管内的正常运行，从而在局部着床形成宫外孕；输卵管周围炎主要是造成输卵管周围粘连，输卵管扭曲，管腔狭窄，影响受精卵的运行。
盆腔手术史相关原因
有过盆腔手术史的女性发生宫外孕的风险会增加。比如曾做过输卵管手术，像输卵管绝育术、输卵管再通术等，手术可能会改变输卵管的结构和功能，使得受精卵难以正常通过输卵管到达子宫腔，进而在输卵管等部位着床形成宫外孕。另外，盆腔子宫内膜异位症也与宫外孕的发生有关，子宫内膜异位症可引起盆腔粘连，改变输卵管的正常解剖结构，影响受精卵的运输，增加宫外孕的发生几率。
避孕方式影响
宫内节育器避孕失败时，发生宫外孕的可能性会增高。因为宫内节育器可能会干扰受精卵在宫腔内的着床，但同时也不能完全阻止受精卵在输卵管等部位着床导致宫外孕。而口服紧急避孕药也可能影响受精卵的正常运行，比如紧急避孕药可能会影响输卵管蠕动等功能，使受精卵运行受阻，增加宫外孕发生的风险。