肾综合征出血热的症状多样，发病早期通常会有发热表现，一般发热持续3~7天左右。
发热期症状
发热： 多数患者起病急骤，体温可迅速升高至39~40℃以上，呈稽留热或弛张热型，发热同时常伴有全身不适、乏力、头痛、腰痛、眼眶痛等，也就是“三痛”症状。中毒症状： 患者会有食欲减退、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等表现，部分患者还可能出现嗜睡、烦躁、谵妄或抽搐等神经精神症状。
低血压休克期症状
血压下降： 一般在发热末期或热退同时出现血压下降，重者可发生休克。患者会感觉头晕、心慌、口渴、面色苍白、四肢厥冷等。微循环障碍： 此期可出现尿量减少、皮肤黏膜出血点增多等情况，若休克未能及时纠正，会导致重要脏器灌注不足，进一步加重各脏器功能损害。
少尿期症状
尿量减少： 24小时尿量少于400ml为少尿，少于50ml为无尿。患者会出现尿毒症、酸中毒和水电解质紊乱等表现，如恶心、呕吐、腹胀、意识障碍、呼吸深而快等，严重者可出现高血容量综合征，表现为头痛、血压增高、脉压增大、心率增快等。
多尿期症状
尿量增多： 随着肾功能的逐渐恢复，尿量开始增多，由少尿期进入多尿期。此期可分为移行期、多尿早期和多尿后期。移行期尿量虽增多，但血尿素氮和肌酐等反而上升；多尿早期尿量逐日增加，氮质血症未见改善；多尿后期尿量每日可达3000~6000ml甚至更多，此期若水电解质补充不足，易发生脱水及低血钾、低血钠等。
恢复期症状
症状逐渐消失： 尿量逐渐恢复正常，精神、食欲基本恢复，一般需1~3个月才能完全恢复健康，但少数患者可遗留高血压、肾功能障碍、心肌劳损和垂体功能减退等症状。