肾盂肾炎主要是由细菌感染引起的，其中最常见的致病菌是大肠埃希菌，约占60%~80%。
感染途径之一：上行感染
尿道结构因素：女性尿道短而宽，且距离肛门较近，大肠杆菌等致病菌更容易从尿道上行进入膀胱，进而沿输尿管蔓延至肾脏引发肾盂肾炎。比如，女性在性生活后，就容易增加细菌上行感染的风险。局部卫生问题：不注意会阴部清洁，细菌容易滋生，也会增加上行感染肾盂肾炎的几率。
感染途径之二：血行感染
其他部位感染灶：当身体其他部位有感染病灶时，细菌可通过血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。例如，皮肤感染、疖肿、扁桃体炎等，细菌可随血流到达肾脏。像金黄色葡萄球菌感染时，就较容易通过血行播散引发肾盂肾炎。免疫力低下时：当人体免疫力较低时，血行感染引发肾盂肾炎的可能性会增加。比如患有糖尿病、艾滋病等疾病的人群，自身免疫力受到影响，更容易出现血行感染导致肾盂肾炎。
易感人群特点
女性群体：女性由于生理结构的特殊性，比男性更易患肾盂肾炎。尤其是育龄女性，怀孕时子宫增大压迫输尿管，会影响尿液正常排出，增加肾盂肾炎的发病风险。据统计，育龄女性肾盂肾炎的发病率明显高于同龄男性。泌尿系统结构异常者：如果存在泌尿系统结石、畸形等结构异常情况，会阻碍尿液正常流通，使细菌容易在局部滋生繁殖，从而引发肾盂肾炎。比如输尿管有结石梗阻，就会导致尿液引流不畅，增加感染机会。尿路器械检查后人群：进行导尿、膀胱镜检查等尿路器械检查时，可能会损伤尿路黏膜，还可能将细菌带入尿路，从而引发肾盂肾炎。检查后需要密切观察，如有不适及时就医。