扁平苔癣的治疗需综合考虑多种因素，目前并没有绝对意义上的“最佳治疗方法”，但可以通过药物治疗、物理治疗等方式来改善。一般来说，治疗会根据病情的轻重等情况选择合适的方案。
药物治疗常用药物
糖皮质激素： 是治疗扁平苔癣常用的药物之一，如泼尼松等，可通过口服或局部涂抹的方式使用，能起到抗炎等作用。局部涂抹的糖皮质激素药膏如糠酸莫米松乳膏等，对于缓解局部的炎症、瘙痒等症状有一定效果。免疫抑制剂： 像环孢素等免疫抑制剂也可用于扁平苔癣的治疗，适用于病情较为严重或对其他治疗反应不佳的情况。不过使用免疫抑制剂需要密切监测身体的不良反应。
物理治疗方式
激光治疗： 对于一些局限性的扁平苔癣皮损可以考虑激光治疗。例如二氧化碳激光，通过激光的能量破坏病变组织，但治疗后需要注意局部的护理，避免感染等情况发生，一般治疗后要保持创面清洁干燥等。紫外线照射： 窄谱中波紫外线（NB-UVB）照射也可用于扁平苔癣的治疗，通过特定波长的紫外线照射来调节免疫系统等，起到改善病情的作用，通常需要多次治疗。
生活方式调整要点
避免刺激因素： 患者要注意避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物可能会加重口腔或皮肤等部位扁平苔癣的不适症状。同时要避免饮酒，酒精也可能对病变部位产生刺激。保持口腔清洁： 对于口腔扁平苔癣患者，要注意保持口腔清洁卫生，每天早晚正确刷牙，饭后可以使用清水或淡盐水漱口，减少口腔内细菌等的滋生，有助于病情的控制。