扁平苔藓的治疗需根据病情等综合判断，一般来说，治疗方法包括局部治疗和全身治疗等。
局部治疗方法
局部用药：
糖皮质激素软膏： 如氢化可的松软膏等，可直接涂抹在扁平苔藓患处，能减轻炎症反应。通常每天涂抹2 - 3次，可缓解局部的瘙痒、充血等症状。维A酸制剂： 像维A酸乳膏，能调节上皮细胞的生长和分化，对扁平苔藓有一定的治疗作用。使用时要注意避免接触眼睛和口腔黏膜等部位。
全身治疗情况
免疫调节剂：
羟氯喹： 具有免疫调节和抗炎作用，可用于治疗扁平苔藓。但使用期间需要定期监测眼底等情况，因为长期使用可能会对眼底有一定影响。硫唑嘌呤： 属于免疫抑制剂，对于病情较严重的扁平苔藓患者可能会用到。不过使用该药物时要密切观察血常规等指标，因为它可能会抑制骨髓造血功能。
物理治疗方式
激光治疗：
二氧化碳激光： 利用激光的能量去除病变组织。对于一些局限性的扁平苔藓病变可以采用，治疗后要注意局部护理，防止感染，一般治疗后创面会在1 - 2周左右愈合。
光化学疗法：
PUVA疗法： 即补骨脂素联合紫外线A照射。通过特定的药物和紫外线照射来调节免疫系统，达到治疗扁平苔藓的目的。但治疗过程中要注意防护，避免紫外线对正常皮肤的过度损伤。