慢粒白血病的具体引起原因目前尚未完全明确，但有一些相关因素被广泛研究。目前认为，费城染色体异常是慢粒白血病发病的重要分子基础，大约90% - 95%的慢粒白血病患者存在费城染色体，它是由9号染色体和22号染色体长臂部分相互易位形成的。
遗传因素相关情况
家族遗传倾向： 虽然慢粒白血病不是典型的单基因遗传性疾病，但有研究发现，某些遗传背景可能会增加患慢粒白血病的风险。如果家族中有亲属患有慢粒白血病，那么家族其他成员患该病的概率会比普通人群略有升高，但这并不是绝对会发病，只是相对风险有所增加。染色体异常遗传传递： 费城染色体的异常如果是由于亲代遗传而来的某种染色体结构变异，可能会使子代更容易出现慢粒白血病相关的细胞遗传学改变。不过这种遗传传递并不是简单的孟德尔遗传方式，而是涉及到复杂的染色体水平的遗传变异情况。
环境因素相关情况
电离辐射影响： 长期接触较高剂量的电离辐射是慢粒白血病的危险因素之一。比如在核事故现场，暴露于电离辐射的人群患慢粒白血病的几率会明显升高。研究表明，接受胸部放疗的患者，若干年后患慢粒白血病的风险比正常人群要高。化学物质接触： 长期接触某些化学物质也可能诱发慢粒白血病。例如长期接触苯及其衍生物的人群，像一些化工厂长期工作的工人，患慢粒白血病的风险较一般人群增加。苯可以影响骨髓造血干细胞的正常功能，导致染色体发生异常改变，从而增加患慢粒白血病的可能性。
病毒感染相关情况
逆转录病毒感染： 有研究提示，某些逆转录病毒可能与慢粒白血病的发生有关。比如C型RNA肿瘤病毒，它可以整合到宿主细胞的基因组中，引起细胞的转化，导致细胞异常增殖，进而可能引发慢粒白血病。不过目前对于病毒感染与慢粒白血病具体的作用机制还在不断深入研究中，病毒感染只是被认为是可能的诱发因素之一，并不是所有感染该病毒的人都会患慢粒白血病。