怀孕上厕所发现有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕后如果出现褐色分泌物，可能是先兆流产的表现。需要及时就医，医生一般会建议进行超声检查、孕激素水平测定等，以确定胎儿的情况。如果是先兆流产，医生可能会建议卧床休息、使用孕激素等药物进行保胎治疗。
2.异位妊娠：受精卵在子宫以外的部位着床发育，称为异位妊娠，也称宫外孕。宫外孕时，随着孕囊的生长，会导致子宫蜕膜剥离，引起阴道出血，颜色可为褐色。异位妊娠是一种危险的情况，可能会导致大出血，甚至危及生命。如果怀孕后出现腹痛、阴道出血等异常，应及时就医，进行超声检查等，以确定是否为异位妊娠。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生，形成的赘生物，质地脆弱，容易出血。怀孕后，由于激素水平的变化，宫颈息肉可能会增大，导致接触性出血，表现为褐色分泌物。如果是宫颈息肉引起的出血，通常量较少，无其他不适。医生一般会在直视下用血管钳将息肉摘除，然后进行局部止血。
4.其他：除了上述情况外，阴道炎、宫颈炎、胎盘前置、胎盘早剥等也可能导致怀孕后上厕所发现有褐色分泌物。
需要注意的是，褐色分泌物也可能是其他原因引起，如剧烈运动、劳累、压力过大等。因此，如果怀孕后出现褐色分泌物，无论量多量少，都应及时就医，进行相关检查，以确定原因，并采取相应的处理措施。同时，在孕期应注意休息，避免劳累，避免剧烈运动，保持心情舒畅，合理饮食，按时产检。