怀孕上厕所发现褐色分泌物可能是以下原因：
1.先兆流产：怀孕初期，胚胎着床不稳定，可能会出现少量褐色分泌物。此外，过度劳累、性生活、剧烈运动、孕酮低等也可能导致先兆流产。如果同时伴有腹痛、阴道流血增多等症状，应及时就医，医生一般会建议进行保胎治疗，常用的保胎药物有黄体酮胶囊、地屈孕酮片等。
2.宫外孕：受精卵在子宫以外的部位着床，也会出现褐色分泌物。宫外孕可能会导致大出血，甚至危及生命，因此需要及时就医，通过超声检查等方式确诊，并采取相应的治疗措施。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生，形成的赘生物，颜色一般为鲜红色或暗红色，质软、脆弱，容易出血。怀孕后，由于激素水平的变化，宫颈息肉可能会长大，导致出现褐色分泌物。如果息肉较大，可能会影响顺产，需要在分娩前进行切除。
4.其他：葡萄胎、胎盘前置、胎盘早剥等也可能导致怀孕后出现褐色分泌物。
总之，怀孕后出现褐色分泌物需要引起重视，建议及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇应注意休息，避免劳累和性生活，保持心情愉快，按时产检。