肠功能紊乱的症状特征多样。一般来说，约有20%-30%的人群会受到肠功能紊乱的困扰。
一、消化系统症状表现
腹痛： 多数患者会出现腹痛情况，疼痛部位不固定，一般为隐痛或胀痛，疼痛程度轻重不一，有的可能只是偶尔轻微不适，有的则会较为明显，但通常在排便后有所缓解。腹胀： 患者常感觉腹部胀满，尤其是在进食后更为明显，有时可自行缓解，有时则会持续较长时间，影响食欲。
二、排便习惯改变
便秘： 表现为排便次数减少，每周排便少于3次，粪便干结、坚硬，排便困难，可能伴有排便不尽感。例如有的患者数天才能排便一次，排出的大便像羊粪蛋一样。腹泻： 大便次数增多，每日排便3次以上，粪便稀薄，呈水样或糊状，严重时可能会出现急迫性腹泻，影响日常生活和工作。有的患者可能会在情绪紧张或进食某些食物后就出现腹泻。
三、其他伴随症状
恶心呕吐： 部分肠功能紊乱患者会出现恶心的感觉，严重时可能会伴有呕吐，呕吐物多为胃内容物。精神症状： 患者可能会出现焦虑、抑郁、失眠等精神方面的症状，这是因为肠道与神经系统关系密切，肠道功能紊乱可能会影响神经递质的平衡，进而导致精神状态的改变。比如有的患者会长期处于焦虑状态，影响睡眠质量，而睡眠不好又会进一步加重肠功能紊乱的症状，形成恶性循环。