两侧肩胛骨内疼痛可能由多种原因引起。比如肌肉劳损就比较常见，长时间保持不良姿势，像久坐、长期伏案工作等，可能导致肩胛骨周围肌肉疲劳，进而引发疼痛，这种情况在经常需要伏案工作的人群中较为多发。
肌肉劳损方面
姿势不良导致： 长时间低头看手机、电脑，或者长期弯腰驼背等不良姿势，会使肩胛骨周围的肌肉持续处于紧张状态，时间一长就容易引发劳损，出现两侧肩胛骨内疼痛。一般来说，这类人群每天如果保持不良姿势超过4 - 6小时，就更容易出现疼痛症状。过度运动引发： 进行了过度的肩部运动，比如过量的俯卧撑、引体向上等锻炼，会使肩胛骨周围肌肉乳酸堆积，或者造成肌肉微小损伤，从而引起疼痛。
骨骼问题方面
肩周炎： 肩周炎多见于50岁左右的人群，但现在也有年轻化趋势。它会导致肩关节周围组织粘连，进而牵涉到肩胛骨内疼痛，患者可能会出现肩关节活动受限，比如手臂上举、外展等动作困难。肩胛骨骨折： 如果有外伤史，比如摔倒时肩部着地等情况，可能会造成肩胛骨骨折，除了疼痛外，还可能伴有局部肿胀、淤血等表现。不过这种情况相对比较少见，但一旦发生就需要及时就医处理。
内脏疾病放射痛方面
心肺疾病： 像冠心病，有时候疼痛会放射到肩胛骨内；胸膜炎等肺部疾病也可能引起肩胛骨内牵涉痛。冠心病引起的放射痛可能还会伴有胸闷、心悸等症状，胸膜炎引起的疼痛可能会随着呼吸加重。当出现两侧肩胛骨内疼痛时，首先要注意观察疼痛的性质、持续时间以及是否伴有其他不适症状。如果疼痛持续不缓解或者伴有胸闷、呼吸困难等严重症状，应及时就医，进行相关检查，比如X线、CT等，以明确病因，采取相应的治疗措施。