蘑菇不能和某些食物一起吃，比如海鲜类食物。像虾和蘑菇一起吃，可能会产生不良影响。另外，还有一些富含维生素B1分解酶的食物也不适合和蘑菇一起吃，比如生鱼、生肉等。
与海鲜类食物同食需注意
螃蟹与蘑菇：螃蟹属于高蛋白的海鲜，蘑菇中的一些物质可能会与螃蟹中的成分相互作用，虽然目前没有确切的大规模数据表明会引发严重中毒等情况，但从饮食搭配角度不建议过量同食。如果大量将螃蟹和蘑菇一起食用，可能会在消化过程中增加胃肠负担，尤其是本身胃肠功能较弱的人，更容易出现消化不良等问题。虾与蘑菇：虾含有丰富的蛋白质等营养成分，蘑菇里含有的一些酶类等物质，若大量同时食用虾和蘑菇，可能会影响蛋白质的消化吸收效率。一般建议间隔一段时间分别食用，避免对胃肠消化功能造成过度影响。
与含维生素B1分解酶食物同食风险
生鱼与蘑菇：生鱼中含有较多的维生素B1分解酶，蘑菇中含有一定量的维生素B1。如果生鱼和蘑菇一起吃，维生素B1分解酶会分解蘑菇中的维生素B1，长期这样可能会导致人体缺乏维生素B1，从而出现食欲不振、消化不良、脚气病等问题。虽然一次少量食用可能不会马上出现明显不适，但长期不良搭配还是要避免。生肉与蘑菇：生肉同样可能含有维生素B1分解酶，当和蘑菇一起食用时，也会有分解蘑菇中维生素B1的风险，进而影响人体对维生素B1的正常摄取和利用，对身体健康产生潜在不利影响。
与某些水果同食的情况
柿子与蘑菇：柿子中含有较多的鞣酸等成分，蘑菇富含蛋白质等营养物质。如果蘑菇和柿子一起吃，鞣酸可能会与蘑菇中的蛋白质结合，形成不易消化的物质，容易导致胃肠不适，出现腹痛、腹胀等症状。尤其是在空腹状态下，这种情况更容易发生。一般建议食用蘑菇后，间隔一段时间再吃柿子，给胃肠消化留出缓冲时间。