肛瘘的常见症状主要有以下这些。肛瘘一般会有肛周反复肿痛的情况，比如有的患者会每隔一段时间就出现肛周局部的红肿热痛，严重时可能会伴有发热，体温可达到38℃左右。
肛周反复流脓
瘘口流脓：肛瘘患者的肛周会有瘘口，经常会有脓性、血性或者黏液性的分泌物流出。分泌物的量时多时少，在肛瘘急性发作时，流脓量会增多。比如有的患者每天可能会有几次脓性分泌物从瘘口流出。污染衣物：这些脓性分泌物会污染患者的内裤，给患者的生活带来不便，需要经常更换衣物。
瘙痒不适
局部瘙痒：由于肛瘘流出的分泌物刺激肛周皮肤，患者会感到肛周瘙痒难耐。长期的瘙痒会让患者忍不住搔抓，进而可能导致肛周皮肤破损、感染加重等情况。比如有的患者因为肛周瘙痒，晚上都睡不好觉。皮肤变化：长期受分泌物刺激，肛周皮肤可能会出现湿疹样改变，皮肤颜色变深、粗糙等。
疼痛表现
间歇性疼痛：当肛瘘的瘘管通畅时，疼痛可能不明显，但当瘘管引流不畅时，会出现疼痛。疼痛一般为胀痛或者跳痛，而且是间歇性发作。例如，有的患者在排便时，因为粪便通过瘘管，会刺激周围组织，从而引发疼痛。急性发作时剧痛：如果肛瘘发生急性感染，形成脓肿，那么疼痛会突然加剧，呈持续性剧烈疼痛，还可能伴有明显的红肿，触摸时疼痛更明显。