眼睛一大一小可能由多种原因引起。其中一种常见原因是先天性因素，比如先天性眼睑下垂，据统计，新生儿中约有0.12% - 0.15%存在先天性眼睑下垂相关问题，这是由于眼部肌肉发育异常导致一侧眼睛上睑位置较低，看起来比另一侧小。
先天性因素
先天性眼睑下垂： 主要是胚胎发育过程中提上睑肌发育不全或其支配神经核发育异常所致，表现为单侧或双侧眼睑下垂，使得一侧眼睛外观较小。先天性眼球发育异常： 比如一侧眼球先天性小，就会直观地呈现出眼睛一大一小的状况，这是胚胎时期眼球发育阶段出现异常导致的。
后天性因素
眼部外伤： 眼部受到外伤后，可能会引起眼睑肿胀、出血，进而导致眼睛外观一大一小。例如眼部遭受撞击后，局部组织损伤、淤血，短时间内就会出现明显的双眼大小差异。眼部疾病： 像一侧眼眶内长肿瘤，随着肿瘤逐渐增大，会压迫周围组织，导致患侧眼睛突出或外观变小，从而出现双眼大小不同。还有一侧眼眶炎症，如眼眶蜂窝织炎，会引起局部组织肿胀，也可能造成眼睛一大一小的情况。神经系统疾病： 例如面神经麻痹，会导致一侧眼轮匝肌瘫痪，引起眼睑闭合不全，看起来患侧眼睛较大或较小，具体情况因病情而异；而动眼神经麻痹等疾病也可能影响眼部肌肉运动，导致眼睛一大一小。