牙结石主要是由口腔内的细菌、食物残渣等逐渐钙化形成的。一般来说，口腔卫生状况不佳的人更容易长出牙结石，比如每天刷牙少于2次的人群。
口腔细菌的作用
细菌黏附： 口腔中的细菌会黏附在牙齿表面，它们以食物残渣中的糖分等为营养物质进行代谢，产生一些黏性物质。这些黏性物质就像“胶水”一样，会把更多的细菌和食物碎屑等黏附在牙齿上。例如，变形链球菌等常见口腔细菌就会积极参与这个黏附过程。菌斑形成： 随着时间推移，越来越多的细菌、食物残渣等不断堆积，就会形成菌斑。菌斑是一种比较柔软的、无色的物质，如果不及时清理，就会逐渐发生变化。
钙化过程
矿物质沉积： 口腔中的唾液含有钙、磷等矿物质，菌斑中的细菌代谢产物等会改变口腔局部的酸碱度等环境，使得唾液中的钙、磷等矿物质逐渐沉积在菌斑上。这个过程是一个缓慢的钙化过程，一开始可能只是比较疏松的沉积物，随着时间的延长，沉积物会越来越坚硬，慢慢就形成了牙结石。比如，经过几周甚至几个月的时间，最初的菌斑就可能逐渐钙化变成牙结石。不同部位的差异： 在牙齿的颈部等部位，由于食物容易残留，而且唾液中的矿物质更容易沉积，所以牙结石往往更容易在这些部位形成。而在牙齿的光滑面，如果口腔卫生较好，相对来说牙结石形成会慢一些，但如果口腔卫生长期不佳，同样也会形成牙结石。
口腔卫生习惯的影响
刷牙不彻底： 如果刷牙的方法不正确，或者刷牙时间过短，比如每次刷牙时间少于1分钟，就很难将牙齿表面的菌斑、食物残渣等彻底清除干净。这样就为牙结石的形成提供了良好的条件。例如，很多人只是简单地刷几下牙，没有全面清洁牙齿的各个面，导致一些角落的菌斑残留下来。不使用牙线等辅助工具： 仅仅依靠刷牙，很难完全清除牙齿邻面（两个牙齿相邻的面）的菌斑和食物残渣。如果不使用牙线、牙缝刷等辅助清洁工具，邻面就容易成为菌斑堆积的地方，进而促进牙结石的形成。比如，牙齿邻面是很多人容易忽视清洁的部位，长期下来就容易长出牙结石。