慢性疲劳综合症是一种持续或反复发作的疲劳状态，患者会有多种表现。一般来说，慢性疲劳综合症的典型表现有以下这些。
身体方面的表现
疲劳感突出： 患者会感觉极度疲劳，这种疲劳不是通过休息能轻易缓解的，持续时间可能长达6个月以上。比如日常简单的活动，像爬几层楼梯、做一点家务，都会让患者感觉比正常人疲惫很多，且休息数小时甚至一整天都难以恢复精力。肌肉与关节症状： 不少患者会出现肌肉疼痛，全身多处肌肉都可能受累，像颈部、肩部、腰部等部位的肌肉容易酸痛。同时关节也可能有不适，比如关节疼痛、僵硬，活动时能感觉到明显的不灵活，尤其是早晨起床后关节僵硬感较为明显。
神经系统相关表现
睡眠问题： 患者常常存在睡眠障碍，可能入睡困难，即使睡着了也容易多梦、易醒，睡眠质量很差。长期睡眠不好又会进一步加重疲劳感，形成恶性循环。例如有的患者晚上躺在床上很久都无法入睡，即便睡着了，稍微有点动静就会醒来，导致整个睡眠过程断断续续。认知功能异常： 会出现记忆力减退、注意力不集中的情况。患者可能记不住刚发生的事情，在工作或学习中难以集中精力完成任务，像原本熟悉的工作流程，突然就会出现遗忘步骤的情况，影响工作效率。
其他系统表现
消化系统症状： 部分患者有消化系统方面的表现，比如食欲不振，对食物没有兴趣，进食量明显减少。还可能出现腹胀、腹痛、便秘或腹泻等胃肠功能紊乱的情况，比如经常感觉肚子胀，或者出现无规律的腹泻现象。免疫系统表现： 患者的免疫系统可能会受到影响，表现为容易反复感冒、感染，相比正常人更容易生病，而且生病后恢复的时间也会比常人长。例如一年中感冒的次数明显多于其他人，且每次感冒痊愈都需要更长的时间。