三个月婴儿睡觉摇头，可能是以下原因导致：
1.正常的生理现象：三个月的婴儿神经系统还没有发育完善，控制能力比较弱，可能会出现一些不自主的运动，包括睡觉摇头。这种情况通常是正常的，随着婴儿的成长，会逐渐消失。
2.湿疹：如果婴儿头部有湿疹，会因为瘙痒而出现摇头的现象。此外，湿疹还可能导致婴儿头皮发红、脱屑等症状。
3.缺钙：缺钙可能导致婴儿神经兴奋性增加，从而出现睡觉摇头、多汗、易惊等症状。
4.头皮瘙痒：如果婴儿没有及时清洗头发，或者头皮有污垢，也可能会导致头皮瘙痒，引起婴儿摇头。
5.中耳炎：如果婴儿患有中耳炎，会因为耳部疼痛而出现摇头的现象。中耳炎还可能导致婴儿哭闹、发热等症状。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.保持婴儿头部清洁：及时为婴儿清洗头发，避免污垢积累。
2.注意卧室温度和湿度：保持卧室温度适宜，空气流通，避免过于干燥或潮湿。
3.给婴儿补充维生素D和钙剂：如果怀疑婴儿缺钙，可以在医生的指导下给婴儿补充维生素D和钙剂。
4.治疗湿疹：如果婴儿头部有湿疹，可以在医生的指导下使用湿疹膏等药物进行治疗。
5.观察婴儿的其他症状：如果婴儿除了睡觉摇头外，还伴有其他异常症状，如哭闹、发热、腹泻等，应及时带婴儿就医，以便明确病因，进行针对性治疗。
需要注意的是，如果婴儿睡觉摇头的情况比较严重，或者持续时间较长，或者伴有其他异常症状，应及时带婴儿就医，以便明确病因，进行针对性治疗。同时，在日常生活中，应注意观察婴儿的情况，如有异常，应及时就医。