三个月大婴儿睡觉摇头，通常是由以下原因引起：1.生理因素：神经系统发育不完善：三个月大的婴儿神经系统还未发育完全，容易出现兴奋、激动等情况，从而导致摇头
出汗：婴儿新陈代谢旺盛，头部容易出汗，汗液刺激头皮会使婴儿感到瘙痒，从而出现摇头的现象
习惯：如果婴儿在睡前有摇头的习惯，也可能会在睡觉时继续摇头。2.病理因素：湿疹：如果婴儿头部有湿疹，会出现瘙痒症状，从而导致婴儿摇头
中耳炎：中耳炎会导致婴儿耳部疼痛，从而出现摇头的现象
缺钙：缺钙会导致婴儿神经兴奋性增加，从而出现多汗、摇头、烦躁等症状。
针对以上原因，可以采取以下措施：1.保持头部清洁：及时给婴儿清洗头部，保持头部清洁干燥。2.选择合适的衣物和枕头：给婴儿选择透气、吸汗的衣物和枕头，避免头部过热
3.注意观察：注意观察婴儿的头部是否有湿疹、中耳炎等异常情况。4.补充维生素D和钙剂：如果怀疑婴儿缺钙，可以带婴儿到医院进行检查，在医生的指导下补充维生素D和钙剂
5.及时就医：如果婴儿摇头的情况严重，或者伴有其他异常症状，如哭闹、烦躁、呕吐等，应及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。