生殖器官疱疹主要是由单纯疱疹病毒（HSV）引起的，其中约90%由单纯疱疹病毒Ⅱ型（HSV-2）导致，10%由单纯疱疹病毒Ⅰ型（HSV-1）引起。
病毒传播途径
性接触传播： 这是最主要的传播方式。与患有生殖器官疱疹的患者发生无保护的性行为，包括阴道性交、肛门性交、口交等，都有可能感染病毒。例如，在性活跃人群中，如果一方感染了HSV，通过性接触很容易将病毒传染给另一方。母婴传播： 患有生殖器官疱疹的孕妇在分娩过程中，胎儿经过产道时可能会感染HSV。据统计，约有30% - 50%的新生儿会在这种情况下被感染，从而引发新生儿疱疹，可能导致严重的健康问题，如脑炎、肺炎等。
自身免疫因素
免疫力低下： 当人体的免疫力处于较低水平时，更容易感染生殖器官疱疹病毒。比如，长期患有慢性疾病（如艾滋病、糖尿病等）、过度劳累、长期精神压力大等情况，都会使身体的免疫功能下降。以艾滋病患者为例，他们的免疫系统受到严重破坏，感染HSV的风险比正常人高很多，而且一旦感染，病情往往更严重，复发频率也更高。激素变化影响： 体内激素的变化也可能影响生殖器官疱疹的发病。例如，女性在月经周期、怀孕等特殊时期，体内激素水平会发生改变，这可能导致免疫力出现波动，从而增加感染或复发生殖器官疱疹的几率。比如，有些女性在月经前后容易出现生殖器官疱疹的复发情况，这与月经期间体内激素变化有关。
接触污染物品
间接接触传播： 虽然这种传播方式相对较少，但也有可能发生。例如，接触了被患者污染的毛巾、浴盆、马桶坐垫等物品，如果皮肤有细微破损，就有可能感染病毒。不过，这种情况发生的概率比较低，因为单纯疱疹病毒在外界环境中的存活能力相对较弱，离开人体后很快就会失去活性。但在一些卫生条件较差的公共场合，还是需要引起注意，尽量避免接触可能被污染的物品。