肾结石形成原因较多，其中尿液中某些物质浓度过高是关键。比如尿液中钙、草酸、尿酸等成分浓度过高，超过了尿液的溶解限度，就容易析出形成结晶，进而发展成肾结石。一般来说，肾结石患者每天饮水量应达到2000~3000毫升以上，以稀释尿液中相关物质浓度，降低结石形成风险。
代谢异常方面
尿液成分异常：当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质排出量增加时，就容易形成肾结石。例如，尿钙排泄增多，就会使尿液中钙的浓度升高，增加钙盐结晶形成的可能。研究发现，约有80%的肾结石患者存在尿液成分异常的情况。肠道吸收功能异常：肠道对草酸盐的吸收增加时，会导致尿液中草酸含量增多。像一些患有胃肠道疾病的患者，肠道功能紊乱，可能会使草酸盐吸收异常，从而增加肾结石形成几率。
局部因素影响
尿路梗阻：尿路存在梗阻时，尿液排出受阻，会导致尿液中一些物质在局部积聚，容易形成结石。比如肾盂输尿管连接处狭窄，就会引起尿液潴留，为结石形成创造条件。而且尿路梗阻还会影响肾脏对尿液的正常排泄和重吸收功能，进一步促进结石形成。尿路感染：尿路感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使晶体沉积，从而形成结石。例如变形杆菌等细菌感染时，会分解尿素产生氨，使尿液碱化，导致磷酸镁铵等晶体沉积，引发肾结石。
生活方式因素
饮水过少：长期饮水不足会使尿液浓缩，尿液中各种溶质的浓度升高，容易形成结晶，进而发展为肾结石。建议每天保证足够的饮水量，维持尿液的稀释状态。饮食不合理：高嘌呤饮食会使尿酸生成增多，增加尿酸结石形成风险，比如长期大量食用动物内脏、海鲜等。高草酸饮食也会增加肾结石风险，像菠菜、巧克力、坚果等富含草酸的食物，如果摄入过多且饮水不足，就容易形成草酸钙结石。