手上长扁平疣主要由人乳头瘤病毒感染引起，且免疫力低、外伤等因素可能促使其产生。
一、免疫力低。
人乳头瘤病毒感染是手上长扁平疣的根本原因，该病毒存在多种类型，其中HPV-3型是导致扁平疣的主要类型。当机体免疫力低下时，在接触到人乳头瘤病毒后就更容易被感染，进而引发手上长扁平疣。
二、外伤。
如果手部皮肤有小的伤口，且没有做好消毒处理，那么人乳头瘤病毒就可能通过皮肤黏膜的破损处侵入皮肤内部。病毒在手部进行复制、繁殖，可能导致上皮细胞出现异常的分化和增生，从而引起手上长扁平疣。此外，接触携带病毒的物品或接触患者的血液、体液等，也有很大几率导致手上长扁平疣。
总之，人乳头瘤病毒感染是手上长扁平疣的关键，而免疫力低和外伤等情况会增加长扁平疣的风险。