手上长扁平疣主要由人乳头瘤病毒感染引起，而免疫力低、外伤等因素可能促使手上长出扁平疣。
一、免疫力低：人乳头瘤病毒感染是手上长扁平疣的根本原因。人乳头瘤病毒存在多种类型，其中HPV-3型是导致扁平疣的主要类型。当机体免疫力较为低下时，在接触到人乳头瘤病毒后就更容易被感染，进而导致手上长出扁平疣。比如长期过度劳累、营养不良、患有慢性疾病等都可能使免疫力下降，增加感染风险。
二、外伤：若手部皮肤有小伤口，且未注意做好消毒处理，那么人乳头瘤病毒就可能通过皮肤黏膜的破损处进入皮肤内部。病毒在手部进行复制、繁殖，可能引发上皮细胞出现异常的分化和增生，从而引起手上长扁平疣。此外，手部接触携带病毒的物品，或者接触患者的血液、体液等，也都有可能造成感染而导致手上长扁平疣。
总之，手上长扁平疣与人乳头瘤病毒感染密切相关，免疫力低和外伤等情况会增加患病的可能性。