直肠黏膜脱垂并无绝对最佳的治疗方式，需依据不同情形予以相应施治。此病症主要出现在幼儿、已分娩妇女以及年老体弱人群中，体现为直肠脱出至肛门内、外，或黏膜有水肿、充血现象，还伴有腹泻、出血等表现。其治疗办法需按照不同病情或人群来选定，可分为保守治疗、注射硬化剂治疗以及手术治疗。
一、保守治疗：主要针对患该病的幼儿及轻度直肠黏膜脱垂患者。幼儿因生长发育，其骶骨弯曲度会逐渐形成，通常可自行痊愈。故而这类患者发生直肠脱垂时可用手将其复位，同时矫正便秘并改进排便习惯，多能缓解相关症状。
二、注射硬化剂治疗：可通过在直肠黏膜下层注射硬化剂，促使直肠黏膜与肌层粘连，或是在直肠周围进行注射。该治疗方法对幼儿和老年人效果尚可，但用于一般成人则较易复发。
三、手术治疗：适用于较为严重的直肠黏膜脱垂，不同的手术形式适用于不同病情的患者。比如直肠黏膜结扎术适用于存在直肠全层脱垂的患者，肛门紧缩术适用于合并有肛门括约肌松弛的患者，吻合器痔上黏膜环切术适用于Ⅱ度以内的直肠黏膜脱垂。
总之，直肠黏膜脱垂的治疗需根据具体情况选择合适的方法，以达到较好的治疗效果。