卵巢囊肿是否要手术不能一概而论，一般直径小于5厘米的生理性囊肿，有一定几率自行消失，通常不需要手术；而直径大于5厘米持续存在的囊肿，或怀疑为恶性的囊肿，则多需要手术。
生理性囊肿的情况
滤泡囊肿： 这是最常见的生理性囊肿，多发生在排卵后，一般直径在2~5厘米左右，多数会在月经来潮后自行消失，通常不需要手术干预，定期复查B超观察其变化即可，比如每1~2个月复查一次。黄体囊肿： 多在怀孕早期或月经后半期出现，一般直径也多小于5厘米，很多会随着月经周期的变化而消失，同样可先定期观察，无需马上手术。
病理性囊肿的情况
子宫内膜异位囊肿： 这种囊肿与子宫内膜异位症有关，囊肿内含有类似巧克力样的液体，直径常超过5厘米，而且会逐渐增大，还可能引起痛经、不孕等问题，一般建议手术治疗。如果患者有生育需求，医生会综合评估后决定手术方式，尽量保留生育功能。浆液性或黏液性囊腺瘤： 属于常见的卵巢上皮性肿瘤，多为单侧发生，肿瘤体积可能会不断增大，有恶变的可能，一旦发现直径大于5厘米且持续存在的，通常需要手术切除。
特殊情况的囊肿
怀疑恶性的囊肿： 如果通过肿瘤标志物检查（如CA125、CA199等）发现异常升高，或者B超提示囊肿边界不清、内部有乳头等可疑恶性表现，不管囊肿大小，都需要尽快手术，通过手术切除后进行病理检查来明确性质。囊肿引起急腹症： 比如卵巢囊肿发生蒂扭转，会突然出现一侧下腹剧烈疼痛，还伴有恶心、呕吐等症状；或者囊肿破裂，引起急性腹痛、腹腔内出血等情况，这种紧急情况下必须马上手术治疗，以免危及生命。