地图舌的病因目前尚未完全明确，可能与多种因素有关。一般认为遗传因素可能是一个方面，有研究显示约有10%~30%的地图舌患儿有家族史。另外，免疫因素也可能参与其中，免疫系统的异常可能导致舌黏膜出现这种特定的病变表现。
营养因素相关
维生素缺乏： 比如缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6等，可能与地图舌的发生有一定关联。有研究发现，部分地图舌患者体内维生素B族水平低于正常人群。微量元素缺乏： 像锌元素缺乏也可能是诱因之一。锌在人体的生长发育、免疫功能等方面都起着重要作用，当体内锌含量不足时，可能影响舌黏膜的正常代谢，从而增加患地图舌的风险。
口腔局部因素
口腔卫生状况： 如果口腔卫生不良，口腔内细菌、真菌等微生物滋生，可能会刺激舌黏膜，引发地图舌。例如，长期不认真刷牙、漱口，导致食物残渣残留，容易造成口腔内环境的紊乱。牙齿排列不齐： 牙齿排列不整齐的人，舌头在口腔内的位置和运动可能受到影响，局部容易出现摩擦、刺激等情况，进而增加地图舌发生的可能性。比如龅牙、牙齿拥挤等情况，都可能对舌黏膜产生不良影响。
其他因素
精神因素： 长期的精神紧张、焦虑、压力过大等精神因素也可能与地图舌有关。当人体处于高度紧张状态时，神经内分泌系统会发生变化，可能影响舌黏膜的血液循环和代谢，导致地图舌的出现。例如，一些学生在考试期间，由于精神压力大，容易出现地图舌的情况。感染因素： 虽然目前还没有确凿证据表明特定的感染直接导致地图舌，但有研究发现部分地图舌患者可能存在潜在的感染灶，如口腔内的慢性炎症等，感染可能通过免疫反应等途径影响舌黏膜，引发地图舌。