怀孕45天出现褐色分泌物可通过多种方法治疗，以避免胎儿停育，具体如下：
一、卧床休息：减少活动量，多卧床休息，可降低对胎儿的刺激，从而缓解下体有褐色分泌物等不良症状。因为过多活动可能会增加子宫的收缩，进而对胚胎产生不利影响，而卧床休息能让子宫处于相对稳定的状态，有助于减少出血情况。
二、加强营养补充：保持清淡且高营养饮食，多吃肉类、水果和蔬菜等营养丰富的食物。这样有利于全面补充身体所需营养，促进营养吸收和胎儿成长。足够的营养能为胎儿发育提供良好的支持，减少因营养缺乏而引发的先兆流产风险。
三、口服用药：多数情况下可在医生指导下使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片等保胎药物。这些药物能促进胎儿健康发育，防止出现发育迟缓等多种危害。通过药物补充孕激素等，能调节体内激素水平，增强胚胎的稳定性。
此外，还可通过静脉输液、物理治疗、住院观察治疗等方法，降低胎儿停育风险。总之，当怀孕早期出现褐色分泌物时，应及时采取合适的措施进行处理和治疗，以保障胎儿的健康发育和安全。