怀孕45天出现褐色分泌物，其原因可能包括正常生理变化，也可能是先兆流产、宫外孕、妇科疾病、血液病等导致。孕妇需明确具体状况以进行针对性治疗。具体如下：
一、正常生理变化：停经45天进行B超检查确定为宫内孕且无其他不适，可能是孕早期生理变化。在孕早期，激素水平波动大，可致使子宫内膜出现部分或少量不规则脱落，一般表现为少量出血，因流出速度慢及在宫腔或阴道内存留时间长而呈褐色。此时孕妇充分休息即可，无需过度担忧。
二、先兆流产：孕妇褐色分泌物增多并伴有下腹部疼痛等不适症状时，需考虑先兆流产可能。先兆流产多发生于发育异常的胎儿，可进行人绒毛膜促性腺激素测定、孕酮测定等检查项目来确诊是否为先兆流产。
三、宫外孕：若孕妇存在宫外孕情况，也会导致怀孕45天有褐色分泌物。此时需进行B超检查，若未见宫内妊娠囊，则考虑异位妊娠，应在专业医生指导下终止妊娠。
四、妇科疾病：孕妇患有某些妇科疾病如宫颈息肉、阴道壁息肉等也会导致出血，从而出现怀孕45天有褐色分泌物症状。此时需去医院完善相应检查以了解出血部位是否因阴道或宫颈病变导致。
五、血液病：孕妇患有某些血液病如凝血功能异常、促凝血功能亢进等，同样可能出现怀孕45天有褐色分泌物症状。此时孕妇要及时完善相应血液检查，并重点关注凝血因子、血小板、凝血酶的量和活性等情况。
总之，怀孕45天出现褐色分泌物有多种可能原因，孕妇应及时就医检查，明确具体原因后采取相应的处理措施。