结膜炎有多种类型，用药需根据具体类型来选。一般来说，细菌性结膜炎可选用抗生素类眼药水，如氧氟沙星滴眼液，它能有效抑制细菌生长，帮助缓解细菌性结膜炎的症状；而病毒性结膜炎可使用抗病毒类眼药水，像阿昔洛韦滴眼液，对病毒性结膜炎有一定的治疗作用。
细菌性结膜炎常用眼药水
抗生素类眼药水： 氧氟沙星滴眼液是常见的用于细菌性结膜炎的眼药水，它通过阻碍细菌DNA合成来发挥杀菌作用。另外还有妥布霉素滴眼液，也可用于治疗细菌感染引起的结膜炎，能抑制细菌蛋白质合成从而达到抗菌效果。
病毒性结膜炎常用眼药水
抗病毒类眼药水： 阿昔洛韦滴眼液适用于病毒性结膜炎，它能干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒的复制。更昔洛韦滴眼液也是常用的抗病毒眼药水，可阻止病毒DNA链的延伸，对病毒性结膜炎有治疗作用。
过敏性结膜炎常用眼药水
抗过敏类眼药水： 色甘酸钠滴眼液可用于预防春季过敏性结膜炎等过敏性眼病，它能稳定肥大细胞细胞膜，阻止肥大细胞脱颗粒释放过敏介质。盐酸奥洛他定滴眼液也是治疗过敏性结膜炎的常用药，能选择性地结合组胺H1受体和抑制肥大细胞释放炎症介质。
非感染性结膜炎的其他注意事项
对于非感染性结膜炎，除了使用相应眼药水外，还需注意远离过敏原。比如过敏性结膜炎患者要尽量避免接触花粉、尘螨等过敏原。同时，要注意眼部卫生，不要用手频繁揉眼，防止加重结膜炎症状。如果是因干眼症等引起的非感染性结膜炎，除了使用人工泪液类眼药水外，还可以通过增加环境湿度等方式来改善眼部不适。