阴茎根部隐隐作痛可能由长时间挤压、局部痉挛、外伤等原因引起，其处理方法包括卧床休息、药物治疗等。具体如下：
一、长时间挤压：
1.若经常挤压阴茎根部，如因常穿紧身衣或久坐等原因，可能导致局部隐隐作痛。
2.通常需要养成良好作息习惯，减少对局部的压迫。若疼痛症状较严重，可口服止痛药物如布洛芬或对乙酰氨基酚来缓解。
二、局部痉挛：
1.当局部发生痉挛时，也会引发阴茎根部隐隐作痛。
2.可通过多喝水、多排尿，起到冲洗尿道的作用，以减轻症状。
三、外伤：
1.阴茎根部若不小心受到外伤磕碰，会致使局部出现隐隐作痛。
2.需到正规医院进行相关检查，查看局部是否受损，然后可在医生指导下用药治疗，同时要注意卧床休息。
此外，前列腺炎也可能导致这种情况，建议到正规医院检查以排除前列腺炎的可能性。
总之，当阴茎根部出现隐隐作痛时，要明确原因并采取相应的处理措施，必要时及时就医。