葡萄胎分为完全性葡萄胎和部分性葡萄胎，判断其是良性还是恶性主要通过以下方面：首先，从影像学检查来看，良性葡萄胎超声检查可见子宫大于相应孕周，宫腔内充满不均质密集状或短条状回声，呈“落雪状”，部分水泡较大时则呈“蜂窝状”；而恶性葡萄胎（侵蚀性葡萄胎）超声检查可见子宫肌层内有局灶性或弥漫性强光点或光团与暗区相间的蜂窝样病灶。
通过临床表现判断
阴道流血情况： 良性葡萄胎多数在停经8 - 12周左右开始出现不规则阴道流血，量多少不定，时出时停，反复发生，逐渐增多；恶性葡萄胎多在葡萄胎排空后出现阴道持续或间断流血。子宫大小： 良性葡萄胎子宫常大于停经月份；恶性葡萄胎子宫多小于或等于正常大小。
依据血清hCG水平判断
hCG增长速度： 良性葡萄胎患者血清hCG水平通常高于相应孕周的正常妊娠值，且在停经12周后仍持续上升；恶性葡萄胎患者葡萄胎排空后hCG持续异常升高，比如葡萄胎排空后9周以上，血清hCG仍持续高水平，或曾一度下降后又上升。hCG下降情况： 良性葡萄胎患者完全排空后，血清hCG稳定下降，首次降至正常的平均时间为9周，最长不超过14周；恶性葡萄胎患者hCG下降缓慢或持续不降。
病理组织学检查判断
良性葡萄胎病理： 显微镜下见绒毛间质水肿，间质内胎源性血管消失或稀少，滋养细胞不同程度增生，增生的滋养细胞包括合体滋养细胞和细胞滋养细胞，两者以不同比例混合存在，并有轻度异型性。恶性葡萄胎病理： 显微镜下可见子宫肌层内有大小不等、形态不规则的水泡状组织，滋养细胞有不同程度的增生，滋养细胞增生程度和异型性比良性葡萄胎显著，常见出血坏死。